注意点
特に説明が無い場合、 画像の通りもしくは アプリケーション標準設定の内容で進めます 。
利用者の名前、所属等については適宜入力して下さい 。
詳細な内容に関しては、公式導入ドキュメントを参照 して下さい 。
導入には管理者権限が必要となります。
Reaction Plus Pro(Linux)
※ ライセンス サーバ の構成はありません 。
※ 本説明では、ユーザー Gaussian で導入するものとして説明しています。
※ 本説明では、opt /Gaussian 下に導入する ものとして説明しています。
※ Gaussian 、GaussView と連携させる場合、それらと同じグループに所属するユーザーにて導入さ
せる必要があります。
...
インストール先ディレクトリを作成します。
Code Block |
---|
cd /opt/Gaussian
mkdir reactg1 |
...
インストールファイルをインストール先に展開します。
Code Block |
---|
cd reactg1
tar x v f ~~//<インストールファイルが置かれている先 reactg_20180115.tar.gz |
ライセンス設定
提供されるライセンスファイル“license.txt”を reactg を導入した先に置きます。
...
Reaction Plus Pro(Linux)
Reaction Plus Pro 利用方法
※Reaction Plus Pro で Gaussian 、GaussViewを利用する際は、利用するユーザーを Gaussian 、GaussView が利用可能なグループへ参加させておく必要がります 。
その他、環境は Gaussian を利用する環境に準拠します。
例)利用するシェルを bash とします。
サーバへログインします。
※既にログインしている場合は不要です。Code Block ssh -Y a4.media.hosei.ac.jp -l (lab2022アカウントのユーザ名)# 市ヶ谷
作業領域をユーザーホームディレクトリ下の rpwork とします。
※ユーザーホームディレクトリ下にrpworkがない場合、以下のコマンドで作業領域を作成します。Code Block mkdir rpwork
作業領域に移動します。
Code Block cd rpwork
利用する Gaussian の環境の設定
利用可能 Gaussian のバージョン: g16c.01 、 g16a.03 、 g09e.01
別の Gaussian 16 を利用する場合は、 g16root を利用する Gaussian のものと置き換えます。
[g16c.01の場合]Code Block export g16root=/opt/Gaussian/g16c.01 source $g16root/g16/bsd/g16.profile export GAUSS_SCRDIR=$HOME/scr
[g16a.03 の場合]
Code Block export g16root=/opt/Gaussian/g16a.03 source $g16root/g16/bsd/g16.profile export GAUSS_SCRDIR=$HOME/scr
[g09e.01の場合]Code Block export g09root=/opt/Gaussian/g09e.01 source $g09root/g09/bsd/g09.profile export GAUSS_SCRDIR=$HOME/scr
Reaction Plus Pro の環境の設定
Code Block export REACTGHOME=/opt/Gaussian/reactg1/reactg export PATH=$REACTGHOME/bin:$PATH
実行
[g16c.01の場合]Code Block reactg16 /opt/Gaussian/reactg1/reactg/examples/da.gjf
[g16a.03 の場合Code Block reactg16 /opt/Gaussian/reactg1/reactg/examples/da.gjf
[g09e.01の場合の場合]Code Block reactg09 /opt/Gaussian/reactg1/reactg/examples/da.gjf
指定するログファイルに実行結果を吐き出す場合の実行例:Code Block reactg16 /opt/Gaussian/reactg1/reactg/examples/da.gjf 2>&1 |tee da.screen.out
...
Reaction Plus Pro Version2(LinuxLinux)
・ Reaction Plus Pro Version2 利用方法
※ Reaction Plus Pro Version2 で Gaussian、GaussView を利用する際は、利用するユーザーを Gaussian、GaussView が利用可能なグループへ参加させておく必要がります。
その他、環境は Gaussian を利用する環境に準拠します。
例)利用するシェルを bash とします。
サーバへログインします。
※既にログインしている場合は不要です。Code Block ssh -Y a4.media.hosei.ac.jp -l (lab2022アカウントのユーザ名)# 市ヶ谷
作業領域をユーザーホームディレクトリ下の rp2work とします。
※ユーザーホームディレクトリ下にrp2workがない場合、以下のコマンドで作業領域を作成します。Code Block mkdir rp2work
作業領域に移動します。
Code Block cd rp2work
利用する Gaussian の環境の設定
利用可能 Gaussian のバージョン:g16c.01、g16a.03、g09e.01
別の Gaussian16 を利用する場合は、g16root を利用する Gaussian のものと置き換えます。
[g16c.01の場合]Code Block export g16root=/opt/Gaussian/g16c.01 source $g16root/g16/bsd/g16.profile export GAUSS_SCRDIR=$HOME/scr
[g16a.03 の場合]
Code Block export g16root=/opt/Gaussian/g16a.03 source $g16root/g16/bsd/g16.profile export GAUSS_SCRDIR=$HOME/scr
[g09e.01 の場合]
Code Block export g09root=/opt/Gaussian/g09e.01 source $g09root/g09/bsd/g09.profile export GAUSS_SCRDIR=$HOME/scr
Reaction Plus Pro Version2 の環境の設定
Code Block export REACTGHOME=/opt/Gaussian/reactg2/reactg export PATH=$REACTGHOME/bin:$PATH
実行
[g16c.01の場合]Code Block reactg16 /opt/Gaussian/reactg2/reactg/examples/da.gjf
[g16a.03 の場合]
Code Block reactg16 /opt/Gaussian/reactg2/reactg/examples/da.gjf
[g09e.01 の場合]
Code Block reactg09 /opt/Gaussian/reactg2/reactg/examples/da.gjf
指定するログファイルに実行結果を吐き出す場合の実行例:
Code Block reactg16 /opt/Gaussian/reactg2/reactg/examples/da.gjf 2>&1 |tee da.screen.out