Reaction Plus Pro(Linux)
Reaction Plus Pro 利用方法
※Reaction Plus Pro で Gaussian 、GaussViewを利用する際は、利用するユーザーを Gaussian 、GaussView が利用可能なグループへ参加させておく必要がります 。
その他、環境は Gaussian を利用する環境に準拠します。
例)利用するシェルを bash とします。
サーバへログインします。
※既にログインしている場合は不要です。ssh -Y a4.media.hosei.ac.jp -l (lab2022アカウントのユーザ名)# 市ヶ谷
作業領域をユーザーホームディレクトリ下の rpwork とします。
※ユーザーホームディレクトリ下にrpworkがない場合、以下のコマンドで作業領域を作成します。mkdir rpwork
作業領域に移動します。
cd rpwork
利用する Gaussian の環境の設定
利用可能 Gaussian のバージョン: g16c.01 、 g16a.03 、 g09e.01
別の Gaussian 16 を利用する場合は、 g16root を利用する Gaussian のものと置き換えます。
[g16c.01の場合]export g16root=/opt/Gaussian/g16c.01 source $g16root/g16/bsd/g16.profile export GAUSS_SCRDIR=$HOME/scr
[g16a.03 の場合]
export g16root=/opt/Gaussian/g16a.03 source $g16root/g16/bsd/g16.profile export GAUSS_SCRDIR=$HOME/scr
[g09e.01の場合]export g09root=/opt/Gaussian/g09e.01 source $g09root/g09/bsd/g09.profile export GAUSS_SCRDIR=$HOME/scr
Reaction Plus Pro の環境の設定
export REACTGHOME=/opt/Gaussian/reactg1/reactg export PATH=$REACTGHOME/bin:$PATH
実行
[g16c.01の場合]reactg16 /opt/Gaussian/reactg1/reactg/examples/da.gjf
[g16a.03 の場合reactg16 /opt/Gaussian/reactg1/reactg/examples/da.gjf
[g09e.01の場合の場合]reactg /opt/Gaussian/reactg1/reactg/examples/da.gjf
指定するログファイルに実行結果を出力する場合の実行例:reactg16 /opt/Gaussian/reactg1/reactg/examples/da.gjf 2>&1 |tee da.screen.out
Reaction Plus Pro Version2(Linux)
・ Reaction Plus Pro Version2 利用方法
※ Reaction Plus Pro Version2 で Gaussian、GaussView を利用する際は、利用するユーザーを Gaussian、GaussView が利用可能なグループへ参加させておく必要がります。
その他、環境は Gaussian を利用する環境に準拠します。
例)利用するシェルを bash とします。
サーバへログインします。
※既にログインしている場合は不要です。ssh -Y a4.media.hosei.ac.jp -l (lab2022アカウントのユーザ名)# 市ヶ谷
作業領域をユーザーホームディレクトリ下の rp2work とします。
※ユーザーホームディレクトリ下にrp2workがない場合、以下のコマンドで作業領域を作成します。mkdir rp2work
作業領域に移動します。
cd rp2work
利用する Gaussian の環境の設定
利用可能 Gaussian のバージョン:g16c.01、g16a.03、g09e.01
別の Gaussian16 を利用する場合は、g16root を利用する Gaussian のものと置き換えます。
[g16c.01の場合]export g16root=/opt/Gaussian/g16c.01 source $g16root/g16/bsd/g16.profile export GAUSS_SCRDIR=$HOME/scr
[g16a.03 の場合]
export g16root=/opt/Gaussian/g16a.03 source $g16root/g16/bsd/g16.profile export GAUSS_SCRDIR=$HOME/scr
[g09e.01 の場合]
export g09root=/opt/Gaussian/g09e.01 source $g09root/g09/bsd/g09.profile export GAUSS_SCRDIR=$HOME/scr
Reaction Plus Pro Version2 の環境の設定
export REACTGHOME=/opt/Gaussian/reactg2/reactg export PATH=$REACTGHOME/bin:$PATH
実行
[g16c.01の場合]reactg16 /opt/Gaussian/reactg2/reactg/examples/reactg/da.gjf
[g16a.03 の場合]
reactg16 /opt/Gaussian/reactg2/reactg/examples/reactg/da.gjf
[g09e.01 の場合]
reactg09 /opt/Gaussian/reactg2/reactg/examples/reactg/da.gjf
指定するログファイルに実行結果を出力する場合の実行例:
reactg16 /opt/Gaussian/reactg2/reactg/examples/da.gjf 2>&1 |tee da.screen.out